Faba bohne (Vicia faba), oft Saubohne genannt, ist weltweit eine der wichtigsten Nahrungs- und Futterleguminosen. Ackerbohnen enthalten sehr viel Eiweiß und Ballaststoffe. Aus agronomischer Sicht sind sie aufgrund ihrer Fähigkeit, atmosphärischen Stickstoff zu binden, nachhaltiger als Getreidepflanzen, wodurch der Düngemittelverbrauch reduziert wird. Es kann unter begrenzter Bewässerung, mäßigem Salzgehalt und niedrigen Temperaturbedingungen wachsen.

Da die Nachfrage nach Pflanzenprotein und gesünderen Alternativen zu Fleisch Jahr für Jahr wächst, muss man sich auf die Züchtung neuer, ertragreicherer und widerstandsfähigerer Ackerbohnensorten konzentrieren. Allerdings ist die Verwendung der markergestützten Selektion zur Verbesserung der Ackerbohne derzeit durch die Verfügbarkeit von genomischen DNA-Sequenzdaten begrenzt.

Screenshots der VfODB-Datenbank (A) VfODB-Homepage (B) Molecular Markers-Seiten (C) MicroRNA-Seite (D) Molecular Maps-Seiten (E) Tools-Seiten (F) Germplasm-Seite und G) Submission-Seite. Bildnachweis: Mokhtar et al.

In ihrem neuen Artikel veröffentlicht in AoBP, Mokhtar et al. präsentieren die Vicia faba Omics-Datenbank (VfODB) als umfassender Open-Access-Hub für Keimplasmainformationen, Expressed Sequence Tags (ESTs), Expressed Sequence Tags-Simple Sequence Repeats (EST-SSRs) und Mitochondrial-Simple Sequence Repeats (mtSSRs), microRNA-Target-Marker und Genkarten in Ackerbohnen. Die VfODB integriert 31536 EST, 9071 EST-SSR und 3023 microRNA-Zielmarker, die basierend auf entwickelt wurden V. faba RefTrans-V2-Mining.

Mokhtar et al. Hoffe, dass VfODB wird als leistungsstarke Datenbank für die Ackerbohnen-Forschungsgemeinschaft und Züchter dienen, die sich für Genomics-Assisted Breeding interessieren. Der VfDie ODB-Datenbank wird regelmäßig mit neu veröffentlichten Genomik-, Transkriptomik- und Literaturressourcen aktualisiert. Darüber hinaus werden das Hub-Design und die Tools regelmäßig verbessert, verfeinert und unterstützt.