Eiben sind das Symbol für „Untergang und Finsternis“ und bekannt für ihre lecker aussehenden, aber giftigen Beeren. Im Gegensatz zu vielen anderen Nadelbäumen haben Eiben keine Zapfen. Die Familie der Eiben, Taxaceae, ist in sechs Gattungen unterteilt und hat etwa 30 Arten. Es wurde lange diskutiert, ob Pflaumeneiben (Gattung Cephalotaxus) gehören zu Taxaceae oder bilden eine eigene Familie, Cephalotaxaceae.
Dr. Yunheng Ji und Kollegen von der Kunming Institut für Botanik, die Cornell University und die Yunnan University machten sich daran, die Debatte endgültig beizulegen Sequenzierung und Zusammenbau des Plastidengenoms (Plastom) von neun Cephalotaxus und zwei Torreya Spezies, Zugehörigkeit zu den Taxaceae. Plastiden sind Zellorganellen, wie Mitochondrien oder Chloroplasten, die ihre eigene DNA haben. Der Plastom ist das gesamte genetische Material in einem Plastiden.
Die Forscher fanden heraus, dass sich die Genanordnungen im Vergleich zu anderen Taxaceae-Gattungen drastisch unterschieden, und fossilkalibrierte molekulare Datierungen legten dies nahe Cephalotaxus Arten, beginnend mit C. oliveri, divergierte ungefähr 20.85 Mya während der Oligozän / Miozän-Grenze. Dr. Yunheng Ji hat kürzlich die Plastom-Phylogogenese untersucht von Epiparasiten (Phacellaria glomerata und S. Compressa) und Gattung Dobinea und die Taxonomie vieler anderer Pflanzenarten.
Die zweiblättrigen Hochblätter in den Samenzapfen unterscheiden sich Cephalotaxaceae aus den einfach ovulierenden Hochblättern von Taxaceae. Die 7-9 Arten von Cephalotaxus sind in ganz Asien verbreitet und waren wahrscheinlich Mitte des Eozäns in Europa vorhanden. Die meisten Arten sind durch Lebensraumzerstörung gefährdet könnte aber produzieren Antikrebs-Verbindungen.

Ji und Kollegen sammelten Proben von 11 Eibenarten, die entweder zur Gattung gehörten Cephalotaxus (C. alpina, C. Fortunei, C. Griffithii, C. Hainanensis, C. Harringtonii, C. Nana und C. Oliverioder Torreya (T. fargesii var. yunnanensis, T. jackii) oder könnte entweder zu (C. Manni und C. sinensis) in China. Die Wissenschaftler sequenzierten die Pflanzen-DNA, setzten die Plastome zusammen und führten eine phylogenetische Analyse von insgesamt 31 Nadelbaumarten durch.

Ji und Kollegen fanden heraus, dass es einen deutlichen Unterschied zwischen Cephalotaxaceae und Taxaceae gibt. Der Cephalotaxus Arten, beginnend mit der C. Oliveri, divergierte nach Monsunklima und pleistozänen Klimaschwankungen in Ostasien. Artbildung führte zu C. harringtonia um 8.02 Mya, eine Art, die zu Ehren des Earl of Harrington benannt wurde, einem der ersten, der die Pflanze in einem europäischen Garten anbaute.
„Unsere Ergebnisse haben weiter bestätigt, dass die phylogenetische Rekonstruktion auf der Grundlage von Plastom-Sequenzdaten historische Probleme in phylogenetisch verwirrenden Pflanzengruppen effektiv lösen kann“, schrieben Ji und Kollegen.
Speziation innerhalb aller verwandten Gattungen trat während des späten Miozäns bis Pleistozäns auf, gekennzeichnet durch Vereisungs-/Interglaziationszyklen, die wahrscheinlich eine dramatische Kontraktion/Ausdehnung der Artenbereiche in der nördlichen Hemisphäre verursachten.
„Die evolutionären Profile von Cephalotaxus liefern aufschlussreiches Wissen zum Verständnis des Ursprungs und der Entwicklung des floristischen Paläo-Endemismus in Ostasien.“
