Hier ist eine Zusammenfassung der 20 meistgeteilten Artikel dieser Woche auf Bluesky. Artikel hinter einer Bezahlschranke sind mit 💰 gekennzeichnet; alle anderen sind zum Zeitpunkt der Überprüfung kostenlos zugänglich.

Diese Woche gibt es ein etwas anderes Programm. Ich versuche, ein Programm zu schreiben, das Redakteuren hilft, Artikel für E-Mail und Web zu formatieren, damit das in Zukunft auch jemand anderes erledigen kann. Die Entwicklung ist noch nicht ganz abgeschlossen.

Ein Rezept für ein gutes π. Wie man populationsgenetische Kennzahlen richtig schätzt und warum wir sie systematisch berichten sollten.
Brault, M. et al. Genombiologie und Evolution

Angesichts der Frage nach dem Nutzen der Erzeugung solch großer Mengen genomischer Daten, sei es aus ökologischen oder ökonomischen Gründen, plädieren wir für eine Standardisierung der Datenveröffentlichung, um die langfristige Wiederverwendbarkeit zu gewährleisten. Basierend auf einer Literaturrecherche und zentralen Beispielen betonen wir, dass trotz des wachsenden Datenvolumens die mangelnde methodische Dokumentation und fehlende Metadaten die meisten veröffentlichten Polymorphismus-Datensätze unvergleichbar machen. Dies verhindert die Berechnung aussagekräftiger Statistiken und die Anwendung der FAIR-Prinzipien (Findable, Accessible, Interoperable, Reusable – auffindbar, zugänglich, interoperabel, wiederverwendbar).

Extrazelluläre Antagonisten: Angriff und Gegenverteidigung im Apoplasten 💰
Armer, VJ, van der Hoorn, RAL · Jahresrückblick auf die Phytopathologie

Extrazelluläre Interaktionen spielen eine entscheidende Rolle im evolutionären Wettrüsten zwischen Pflanzen und Pathogenen. Pilzliche, bakterielle und Oomyceten-Pathogene manipulieren den Apoplasten, um pH-Wert, Wasseraufnahme, Zuckergehalt und Nährstoffverfügbarkeit zu regulieren. Pflanzen reagieren auf Infektionen mit einem oxidativen Ausbruch und sezernieren toxische Metabolite und schädliche Hydrolasen. Angepasste Pathogene haben jedoch ausgeklügelte Mechanismen entwickelt, um reaktive und toxische Pflanzenmetaboliten zu neutralisieren und Hydrolasen zu hemmen oder abzubauen. Pathogene entgehen ihrer Erkennung zudem, indem sie ihre Elicitoren verbergen, abbauen oder modifizieren und Zelloberflächenrezeptoren auf verschiedene Weise deaktivieren. In diesem Übersichtsartikel fassen wir unseren aktuellen Wissensstand zu faszinierenden Angriffs- und Abwehrmechanismen in extrazellulären Pflanzen-Pathogen-Interaktionen zusammen.

Die Verringerung der Variabilität bei der Bewertung des Lebensraumzustands ist entscheidend, wenn die Kennzahlen des Naturmarktes den tatsächlichen Wandel der Biodiversität widerspiegeln sollen.
Salamanca Leon, I. et al. Naturschutzwissenschaft und -praxis

Der Bedarf an standardisierten Kennzahlen zur Messung von Biodiversitätsverlusten und -gewinnen hat dazu geführt, dass viele Länder und Initiativen des Privatsektors die gesetzliche Biodiversitätskennzahl Englands für einen obligatorischen Netto-Biodiversitätsgewinn (BNG) anpassen wollen. Der BNG erfordert einen Zuwachs von mindestens 10 % an Biodiversitätseinheiten durch Infrastrukturentwicklung. Die Anzahl der Biodiversitätseinheiten hängt unter anderem von feldbezogenen Habitatzustandsbewertungen ab. Wir haben Simulationen durchgeführt, um den Einfluss von Unsicherheiten bei Zustandsbewertungen zu untersuchen, und festgestellt, dass eine inhärente Variabilität besteht, die zu Verzerrungen führt, selbst wenn der tatsächliche Zustand eines Habitats unverändert bleibt.

Biotische Interaktionsbiogeographie: Ein Rahmen zum Verständnis, wie Arteninteraktionen Biodiversitätsmuster über verschiedene Maßstäbe hinweg prägen.
Galiana, N.Araújo, MB · PLoS Biology

Die Integration von Biogeographie und Ökologie war historisch bedingt durch den Mangel an Daten zu biotischen Interaktionen über große räumliche Skalen hinweg eingeschränkt. Die Entwicklung neuer Methoden und hochwertiger ökologischer Netzwerkdaten auf biogeographischer Ebene ebnet den Weg für eine tiefere Integration beider Disziplinen. Dieser Aufsatz untersucht diese Integration anhand dreier miteinander verbundener Forschungsbereiche: die Auswirkungen biotischer Interaktionen auf die Verbreitung von Arten; der Einfluss von Umweltgradienten auf biotische Interaktionen; und die Auswirkungen biotischer Interaktionen auf die Umwelt. Jüngste Fortschritte und zentrale Herausforderungen werden diskutiert und Vorschläge unterbreitet, wie das Verständnis von Biodiversitätsmustern und -prozessen über verschiedene Maßstäbe hinweg verbessert werden kann.

Besprochen auf Bluesky von @bjenquist.bsky.social.

Ackerflächen ergänzen die Biodiversität in Dauergrünlandflächen in ganz Europa.
Boetzl, FA et al. Nature Communications veröffentlicht

Anhand von 86 gepaarten Dauergrünland- und Rapsfeldern in fünf europäischen Ländern untersuchten wir, wie der Lebensraumtyp die Artenzusammensetzung von Pflanzen, Schmetterlingen, Wildbienen und Laufkäfern prägt und ob eine Zunahme der Grünlandfläche in der Umgebung die Biodiversität von Grünlandflächen auf Rapsfelder ausweitet. Unsere Ergebnisse zeigen, dass der Lebensraumtyp und nicht die Grünlandfläche die Artenvielfalt bestimmt und die Artenzusammensetzung prägt: Pflanzen und Schmetterlinge sind in Grünlandflächen artenreicher, während Wildbienen und Laufkäfer auf Rapsfeldern gleich artenreich oder sogar artenreicher sind.

Fabian A. Boetzl @fboetzl.bsky.social · auf Bluesky

Frisch aus der Presse! 📄Wir haben festgestellt, dass Ackerflächen und naturnahe Grünlandflächen in ganz Europa eine sich ergänzende Biodiversität aufweisen. Naturnahe Lebensräume allein reichen nicht aus, um die Biodiversität in der Landwirtschaft zu gewährleisten – eine biodiversitätsfreundliche Bewirtschaftung von Ackerflächen ist unerlässlich. www.nature.com/articles/s41...

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Verbesserung des Managements von natürlichem Strandmüll zum Schutz der Biodiversität 💰
Gómez-Serrano, M. Á. · Trends in Ökologie & Evolution

Natürliches, vom Meer angespültes Material ist für das Funktionieren des Strandökosystems unerlässlich. Mit steigenden touristischen Ansprüchen an der Küste gewinnen ästhetische Werte an Bedeutung, und die unkontrollierte Müllbeseitigung breitet sich von städtischen auf natürliche Strände aus. Ein Umdenken im Umgang mit Strandmüll ist notwendig, um sicherzustellen, dass organische Abfälle dort, wo sie vom Meer angespült wurden, ihre Funktion erfüllen können.

Miguel A Gómez Serrano @gomezserrano-ma.bsky.social · auf Bluesky

Die restlichen Tiere sind besonders wichtig für die Erhaltung der Strände, die an den Stränden liegen: www.cell.com/trends/ecolo...
Die Pollos de Chorlitejo Patinegro seconden und sie jedes Mal, wenn sie zu einem Peligro gezwungen werden, zu dem auch Paseanten und Bañistas gehören. Mantener los restos en su sio es vita para ellos

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Eine integrierte Analyse von Fossilien und molekularen Divergenzzeitschätzungen legt einen Ursprung der Angiospermen im späten Jura nahe.
Wu, R. et al. · Nature Plants

Molekulare Zeitskalen basieren auf der Kalibrierung der molekularen Evolution anhand geologischer Zeiträume mithilfe von Fossilienfunden. Herkömmliche Kalibrierungsstrategien verwenden jedoch begrenzte und oft subjektiv interpretierte Fossilienfunde. In dieser Studie nutzten wir das Bayes'sche Brownsche Brückenmodell, um datenbasierte Kalibrierungsdichten auf Grundlage umfangreicher Fossilienfunddaten abzuleiten. Dieser Ansatz integriert die Unsicherheit bezüglich der gegenwärtigen und historischen Diversität, um das Alter von Kladen zu schätzen.

Nature Plants @natplants.nature.com · auf Bluesky

Neuer Open-Access-Artikel: „Integrierte Analyse von Fossilien und molekularen Divergenzzeitschätzungen legt einen Ursprung der Angiospermen im späten Jura nahe“ rdcu.be/foNXh

... legen einen Ursprung der Blütenpflanzen im späten Jura nahe, was auf eine verborgene Frühgeschichte der Angiospermen hindeutet.

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Die Qualität der Landschaft bestimmt die ökologischen Reaktionen auf Lebensraumverlust und -fragmentierung.
Fletcher Jr, RJ et al. · Naturökologie & Evolution

Studien deuten darauf hin, dass die Qualität der umgebenden Landschaften die Auswirkungen von Habitatverlust und -fragmentierung auf Arten verändern und Biodiversitätsprognosen in verschiedenen Regionen beeinflussen kann. Da Landschaftsstrukturen komplex sind und sich mit Habitatveränderungen verändern, ist es schwierig, solche Effekte zu isolieren. In einem groß angelegten, mehrskaligen Manipulationsexperiment an einem Pflanzen-Herbivoren-System untersuchen wir daher die Auswirkungen von Habitatverlust, -fragmentierung und der Qualität der umgebenden Landschaft.

Polychrome Aktivitätsprofilierung unterscheidet Cys-Proteasen und ihre Isoformen in Pflanzen.
Zheng, K. et al.b · bioRxiv

Aktivitätsbasierte Profilierung mit Fluoreszenzsonden ist ein leistungsstarkes Werkzeug zur funktionellen Charakterisierung ganzer Enzymklassen in Rohproteomen. Wir haben entdeckt, dass Sondencocktails, bestehend aus dem E-64-Wirkstoffkopf, der über kurze Linker verschiedene Fluorophore trägt, die Markierung von Papain-ähnlichen Cysteinproteasen und ihren Isoformen aufgrund ihrer unterschiedlichen Affinität zu diesen Sonden differenzieren. Dies führt zu einer polychromen Markierung mit spezifischen Farben für verschiedene Proteasefamilien und Isoformen.

Antizipieren, akklimatisieren, erholen und erinnern: Wie die räumlich-zeitliche Signalintegration die Widerstandsfähigkeit von Pflanzen gegenüber Überschwemmungsstress steuert. 💰
Rodriguez-Cisneros, C. et al. Zeitschrift für experimentelle Botanik

Überschwemmungen stellen einen bedeutenden abiotischen Stressfaktor dar, der das Wachstum und Überleben von Landpflanzen einschränkt. Die Fähigkeit von Pflanzengewebe, kritischen Sauerstoffmangel (Hypoxie) und die daraus resultierenden Schäden durch die Sauerstoffaufnahme zu vermeiden oder zu tolerieren, ist für ihr Überleben essenziell. Überflutung löst eine rasche Ethylen- und Hypoxie-Signalgebung aus, die wiederum die Akklimatisierungsreaktionen steuert und so die Widerstandsfähigkeit der Pflanzen fördert. Interessanterweise beeinflussen zahlreiche weitere Umweltfaktoren und interne Faktoren diese kanonischen Signalwege, die mit der Akklimatisierung und Toleranz gegenüber Überschwemmungen in Verbindung stehen. Wir erörtern hier, wie diese integrative, Ethylen- und Hypoxie-abhängige Signalgebung es Pflanzen ermöglicht, potenziellen, durch Überschwemmungen verursachten Hypoxiestress vorherzusehen und sich darauf vorzubereiten, die Akklimatisierung an den jeweiligen Umwelt- und internen Stoffwechselkontext anzupassen und die Sauerstoffaufnahme effektiv zu steuern.

Der pflanzliche Immunrezeptor LORE bindet agonistische und antagonistische 3-Hydroxyfettsäureliganden über eine dynamische Schleife in seiner G-Typ-Lektindomäne.
Shu, LJ et al. bioRxiv

Einblicke in die pflanzliche Proteolyse: Genetisch kodierte Fluoreszenzsensoren als Werkzeuge zur Profilierung von Proteaseaktivitäten 💰
Fernández-Fernández, Á. D. et al. Die Pflanzenzelle

Die genomweite Modellierung der Bindung von pflanzlichen Transkriptionsfaktoren erfasst regulatorische Varianten, die mit phänotypischen Merkmalen assoziiert sind.
Peleke, FF et al. · Nature Communications veröffentlicht

Leibniz IPK @leibnizipk.bsky.social · auf Bluesky

Ein Team um @leibnizipk.bsky.social und @fz-juelich.de hat ein KI-Modell entwickelt, das vorhersagt, wo regulatorische Proteine ​​an die pflanzliche DNA binden, um Gene ein- und auszuschalten. Die Studie wurde in „Nature Communications“ veröffentlicht.

➡️Papier: tinyurl.com/mryxendn
➡️PR: tinyurl.com/37kpbpzh

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Bildgebung der doppelten Befruchtung bei Mais
Calhau, Arkansas, Widiez, T. · bioRxiv

Thomas WIDIEZ @thomaswidiez.bsky.social · auf Bluesky

Wir freuen uns, unser Protokoll zur Bildgebung der Doppelbefruchtung bei Mais mit Ihnen zu teilen! 🌽🔬

???? www.biorxiv.org/content/10.6...

Wir hoffen, dass diese Ressource für Forscher nützlich sein wird, die sich mit Pflanzenvermehrung, Befruchtung und früher Samenentwicklung befassen.

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Eine integrative Analyse der CAM-Photosynthese zeigt deren Einfluss auf den Primärstoffwechsel in Yucca
Wickell, D. et al. Zeitschrift für experimentelle Botanik

In-planta-Haploidieinduktion in Mais und Tomaten durch Störung von KOKOPELLI
Jacquier, NM et al. bioRxiv

Thomas WIDIEZ @thomaswidiez.bsky.social · auf Bluesky

Die Preprint-Woche 😅!.. Zweites Manuskript jetzt auf BioRxiv

▶️ Die Genomeditierung von KOKOPELLI verleiht nicht nur einem, sondern auch mehreren Zellen die Fähigkeit zur Haploidieinduktion.

Zwei Nutzpflanzen: 🌽 Mais & 🍅 Tomate

???? doi.org/10.64898/202...

Ein herzliches Dankeschön an alle Beteiligten und unsere Kooperationspartner: @nathaliegonzalez.bsky.social, @inrae-bfp.bsky.social

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Hitzestress induziert die Bildung unreduzierter männlicher Gameten durch gezielte Beeinflussung der Translation in Arabidopsis-Meiocyten. 💰
Schindfessel, C. et al. Die Pflanzenzelle

Plastoglobuli kompartimentieren die Stickstoffassimilation in Mais - Nature
Chen, D. et al. · Natur

Digitalisierung von Sammlungen zur Erschließung des vollen Potenzials der Palynologie: Eine Fallstudie anhand der Palynologie-Sammlung des Smithsonian.
Jaramillo, C. et al. PFLANZEN, MENSCHEN, PLANET

Pflanzen, Menschen, Planeten @plantspeopleplanet.bsky.social · auf Bluesky

Digitalisierung von Sammlungen zur Erschließung des vollen Potenzials der #Palynologie: Eine Fallstudie anhand der Palynologie-Sammlung des Smithsonian

Methoden- und Technik-Paper von Carlos Jaramillo et al.

nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/...

#NeuesteAusgabe #Pflanzenwissenschaft

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Wenn die Morphologie stillsteht: Eingeschränkte Blütenentwicklung in einer artenreichen Hülsenfruchtgattung
Maianne, M. et al. Annals of Botany

Annals of Botany @annbot.bsky.social · auf Bluesky

🎉 Gute Neuigkeiten! Die Studie „When morphology stands still: constrained floral evolution in a mega-diverse legume genus“ von M. Maianne (@mimomaianne.bsky.social) ist jetzt für 2 Wochen kostenlos verfügbar! 🧵 1/10

👉 doi.org/rbsb

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Titelbild: Treibholz von @abigalejachyms-team / Canva