In der Wurzelspitze ist die Zelllänge eine Funktion ihrer Position innerhalb einer Zelldatei. Anwendung eines mathematischen Ansatzes unter Verwendung eines Algorithmus für multiple strukturelle Änderungen (MSC), Pacheco-Escobedo et al. entwickelten ein räumliches Modell, um zu identifizieren, dass der wachsende Teil der Arabidopsis-Wurzel aus drei diskreten Entwicklungszonen besteht: der Proliferationsdomäne (PD), der Übergangsdomäne (TD) und der Elongationszone (EZ).

Bestimmung der PD/TD-Grenze in der Linie CCS52A1:GUS mit dem MSC-Ansatz
Bestimmung der PD/TD-Grenze in der Linie CCS52A1:GUS mit dem MSC-Ansatz; Die GUS-Expression markiert den Beginn der Endoreduplikation. (A–J) CCS52A1:GUS-Expression in wt-Wurzeln (7 DAS) tritt in TD und EZ auf. Gelbe Rechtecke zeigen das 95 %-KI der Position der letzten PD-Zelle an, die durch den MSC-Ansatz geschätzt wurde. Maßstabsleiste = 50 μm.

Die PD und die TD umfassen das apikale Wurzelmeristem (RAM). Der MSC-Ansatz ermöglicht eine eindeutige, schnelle und automatisierte Bestimmung der RAM/EZ- und der PD/TD-Grenzen. Dieses öffentlich zugängliche Tool erleichtert die Wurzelphänotypisierung verschiedener genetischer Hintergründe und experimenteller Behandlungen.

Problem der Wurzelbiologie

Dieses Papier ist Teil der Sonderheft Wurzelbiologie.