Bewertungen der Phylogenie der Grünalgenklasse Chlorophyceae unter Verwendung von Standard-Einzelmarkern wie 18S rRNA und RBCL, konnten im Allgemeinen nicht mit den robusten Bäumen mithalten, die aus Analysen von Chloroplasten-Genomdaten hervorgegangen sind. Buchheim et al. untersuchen die Ordnungen Chaetophorales, Oedogoniales und Chaetopeltidales und zeigen, dass die Sequenzstrukturanalyse von ITS2 Ergebnisse liefert, die weitgehend mit denen aus genomischen Daten übereinstimmen. Die Technik bietet somit eine wirtschaftliche Ergänzung oder Alternative zu den Einzelmarker-Ansätzen, die in der Grünalgen-Phylogenie verwendet werden.