Neuere Arbeiten an der Grünalge Haematococcus lacustris entdeckte das größte Plastidengenom aller Zeiten: satte 1.35 Mb (mit >90 % nicht-kodierender DNA). In einem kürzlich in AoBP veröffentlichten Übersichtsartikel nimmt David R. Smith dieses gigantische Plastom genauer unter die Lupe und vergleicht es mit anderen großen Organellen-DNAs. David stieß zuerst auf die H. lacustris Chloroplasten-Genom, während er die neueste Kohorte von Plastomen scannte, und stellte zu seiner Bestürzung fest, dass es in einer nicht von Experten begutachteten Zeitschrift geschrieben worden war, die schnell kurze Berichte über neue mikrobielle Chromosomensequenzen veröffentlicht. Er entschied, dass die H. lacustris Plastom verdiente es, von denjenigen in der Chloroplastenforschungsgemeinschaft richtig wahrgenommen und geschätzt zu werden, und eine Rezension war geboren.

Algen mit großen Plastomen
Eukaryotische Algen mit riesigen Plastomen. Im Uhrzeigersinn von links: Haematococcus lacustris-Stamm CCMP 3127, der dem für die Plastomsequenzierung verwendeten Stamm UTEX 2505 entspricht (Bildnachweis: National Center for Marine Algae and Microbiota); die einzellige Rhodellophyceen-Rotalge Corynoplastis japonica (Bildnachweis: Sergio Muñoz-Gómez); und der marine einzellige Ulvophyt Acetabularia sp. (Bildnachweis: Albert Kok).

In seiner Überprüfen, David zeigt, dass die H. lacustris Das kodierende Repertoire von Plastiden ist nicht so ungewöhnlich wie ursprünglich angenommen, da es einen Standardsatz von rRNAs, tRNAs und proteinkodierenden Genen darstellt. Die intergenischen Spacer sind dicht mit Wiederholungen, und in diesen Regionen liegen potenzielle Antworten auf die Quelle einer solchen extremen genomischen Expansion. Durch den Vergleich zweier eng verwandter Stämme von H. lacustris, argumentiert David, dass die Mutationsrate der nichtkodierenden Plastiden-DNA hoch ist und zur Inflation des Plastoms beiträgt. Mit der wachsenden Bedeutung von H. lacustris Als industrielle Alge werden in den kommenden Monaten und Jahren wahrscheinlich eine Menge Sequenzierungsdaten bei der GenBank eintreffen – Musik in Davids Ohren, da dieser Einzeller mit seinem Giganten eines Plastoms uns sicherlich noch viel mehr über die Evolution des Organellengenoms zu lehren hat.

Forscher-Highlight

David Smith

David absolvierte 2005 seinen BSc an der Acadia University im schönen Wolfville, Nova Scotia, Kanada, und zog dann 75 km die Straße hinunter nach Halifax, um an der Dalhousie University (2005–2010) in Genetik zu promovieren und die seltsamen und wackeligen Genome von Grün zu erforschen Algen. Müde vom Atlantischen Ozean reiste er quer durch das Land nach Vancouver für einen Postdoc am Biodiversity Research Center der University of British Columbia (2011–2013), wo er sich weiter mit der Genomentwicklung von Algen beschäftigte. Er trat 2013 eine Assistenzprofessur am Fachbereich Biologie an der University of Western Ontario an und wurde 2018 zum außerordentlichen Professor befördert. Seine Gruppe verbringt zu viel Zeit damit, über die Ursprünge nicht-photosynthetischer Algen (evolutionäre Burnouts) nachzudenken. Sie leisten auch viel wissenschaftliches Schreiben und Wissenschaftskommunikation. Sie finden sie online unter http://www.arrogantgenome.com. Außerhalb des Labors läuft David gerne Marathons und trinkt Wein, aber selten gleichzeitig.