Brassica napus (AACC, Ölraps) ist eine allotetraploide Art, die von der mutmaßlichen diploiden Vorläuferart abgeleitet ist B.rapa (AA) und B. oleracea (CC). Um den Einfluss intensiver Brutbedingungen auf die Evolution der B. Napus Genom, Kovarik et al. verwenden zytogenetische und genomische Ansätze zur Analyse der rDNA-Struktur in 21 Sorten von B. Napus.
(A) Southern-Blot-Hybridisierung genomischer DNA aus mehreren B. napus-Sorten. Im linken Feld wurde der Blot mit der 26S-Sonde hybridisiert. Nach dem Strippen wurde der Blot mit der A-Genom-spezifischen IGS-Sonde rehybridisiert (B). „C“, C-Genom-Banden; „A“, A-Genom-Banden; „A*“ zeigt eine IGS-Familie an, die in einer Untergruppe von B. napus-Sorten amplifiziert wurde. (C) Beispiel einer Southern-Hybridisierung der C-Genom-spezifischen IGS-Sonde. Beachten Sie die starke Hybridisierung der Sonde mit „Yudal“-DNA. (D) Die Radioaktivität der Banden wurde mithilfe eines Phosphorimagers quantifiziert und die Anzahl der Homöologen-Gene als Anteil der C-Genom-rDNA an der Gesamt-rDNA ausgedrückt. Die Zahlen unten zeigen zwei wichtige Chloroplasten-Haplotypen an, die von Cifuentes et al. (2010) identifiziert wurden. In der gleichen Studie wurden die B. napus-Sorten in Gruppen mit niedriger (–), mittlerer (±) und hoher (+) Häufigkeit homöologer Chromosomenpaarung in der Meiose unterteilt (Symbole unten).
Die B. Napus Sorten unterscheiden sich in Grad und Richtung der rDNA-Homogenisierung; die vorherrschende Richtung der Genumwandlung (in Richtung des A-Genoms) korreliert mit der Richtung der Expressionsdominanz, was darauf hinweist, dass Genaktivität für die Interlocus-Genumwandlung erforderlich sein kann.
