Lolium perenne (Ausdauerndes Weidelgras) ist die weltweit am häufigsten angebaute Futter- und Nutzgräserart in gemäßigten Zonen, und es besteht die Notwendigkeit, die genetischen Architekturen der wichtigsten landwirtschaftlichen Merkmale und Kulturpflanzenmerkmale zu verstehen, die umfassendere Umweltleistungen erbringen. Harper et al. zielte darauf ab, genomische Regionen zu identifizieren, die mit landwirtschaftlich wichtigen Merkmalen assoziiert sind, indem eine auf künstlichen Bakterienchromosomen (BAC) basierende physische Karte mit einer genomweiten Assoziationsstudie (GWAS) integriert wurde.

Zwischen ~3600 und 7500 physische Karten-Contigs wurden abgeleitet, abhängig von der verwendeten Software und den Wahrscheinlichkeitsschwellenwerten, und mit ~35 sequenzierten BAC-Klonen integriert, um eine Ressource zu entwickeln, die voraussichtlich den Großteil der L. perenne Genom. Aus dem GWAS wurden acht verschiedene Loci signifikant mit dem Anfahrdatum, der Pflanzenbreite, der Pflanzenbiomasse und der wasserlöslichen Kohlenhydratakkumulation in Verbindung gebracht, von denen sieben mit physischen Kartenkontigs in Verbindung gebracht werden konnten. Dies ermöglichte die Identifizierung einer Reihe von Kandidatengenen.

Die Kombination der physischen Kartierungsressource mit dem GWAS hat es uns ermöglicht, die Suche nach Kandidatengenen auf größere Regionen der zu erweitern L. perenne Genom und identifizierte eine Reihe interessanter Genmodell-Anmerkungen. Diese physikalischen Karten werden bei der Validierung zukünftiger sequenzbasierter Assemblierungen der L. perenne Genom.