Zuordnung der SNP-Allelkonfiguration bei Polyploiden
Zuordnung der SNP-Allelkonfiguration bei Polyploiden

Die Schätzung der Kopienzahl von Allelen für molekulare Marker gilt seit langem als Herausforderung für polyploide Arten. Becken et al. - Zitrus als Modell zur Bewertung der Nützlichkeit des KASPar-Verfahrens, basierend auf kompetitiver allelspezifischer PCR, für die Zuordnung der SNP-Allelkonfiguration. Fünfzehn SNP-Marker wurden erfolgreich entwickelt, die klare Allelsignale erzeugen und die mit früheren Genotypisierungsergebnissen auf diploider Ebene übereinstimmen. Die Ergebnisse zeigen, dass diese Genotypisierungstechnik ein effizienter Weg ist, um heterozygote allelische Konfigurationen innerhalb polyploider Populationen auf genaue, einfache und kostengünstige Weise zuzuordnen. Darüber hinaus kann es für quantitative Studien nützlich sein, wie z. B. relative allelspezifische Expressionsanalyse und Massensegregantenanalyse.