Innere Beziehungen auflösen Hordeum, eine der größten Gattungen der Tribus Triticeae (Hordeae), ist schwierig, da viele Taxa, einschließlich der meisten Polyploiden, hybriden Ursprungs sind. Kartierung phylogenetischer Beziehungen, Cuadrado et al. untersuchen Ursprünge und interspezifische Affinitäten der Allotetraploiden Hordeum Secalin und H. capense mittels molekularer Karyotypisierung.
Mehrere Ziel-In-situ-Hybridisierungen kombinierten GISH mit DNA von H. marinum subsp. gussoneanum als Sonde (gusDNA) und FISH/ND-FISH zur Analyse der chromosomalen Verteilung verschiedener tandemartiger repetitiver DNA-Sonden in Metaphasen/Chromosomen von vier H. secalinum-Akzessionen: (A, B) H231, (C–J) BCC2004, (L, M) H3121 und (N, O) GRA1147. Einige Abbildungen zeigen überlagerte Bilder zur besseren Visualisierung der In-situ-Signale (grün oder pink/rot) im Vergleich zur DAPI-Färbung (blau). (K) Karyotyp von BCC004 für pAs1 in H. secalinum. Die Chromosomen stammen aus derselben Metaphase, die auch für die Karyotypen in Abb. 2A verwendet wurde. Die Chromosomen der Subgenome Xa und I sind gelb bzw. weiß dargestellt. Pfeile in B, E, M und O markieren das Chromosomenpaar mit einem interstitiellen pSc119·2-Signal. Pfeilspitzen in I, J und N kennzeichnen polymorphe rDNA-Loci in H. secalinum-Akzessionen. Sternchen in C und O veranschaulichen den Polymorphismus hinsichtlich des Vorhandenseins/Fehlens der jeweiligen Sonde in den Akzessionen. Maßstabsbalken in K = 10 μm.
Genomische In-situ-Hybridisierung unterscheidet die Subgenome Xa und I, während FISH/ND-FISH die Verteilung von zehn repetitiven DNA-Sequenzen bestimmt. Die Identifizierung jedes Chromosomenpaares in den sechs analysierten Akzessionen enthüllt ein kompliziertes Muster von homologen und mutmaßlich homöologen Beziehungen zwischen Gerstenarten, die das Xa-Genom tragen.
