Die Viehzucht nimmt Land in Anspruch, das anderweitig genutzt werden könnte. Wenn das Land verbessert werden könnte, wäre weniger erforderlich, um das Vieh zu erhalten, aber wie macht man das? Steve Hanley und Kollegen schlagen vor, dass die Verbesserung des Weidegrases helfen könnte. Wenn sie die Verdaulichkeit verbessern könnten, müssten Rinder nicht mehr so ​​viel grasen. Sie argumentieren auch, dass eine Erhöhung des Lipidgehalts die Methanemissionen von Rindern verringern könnte. In einem neuen Papier in Annals of Botany Die Wissenschaftler zeigen wie Allel-Mining könnte die Antwort liefern.

Das Team untersuchte die Gene des C₄Urochloa Arten (syn. Brachiaria) und Megathyrsus maximus (syn. Panik maximal). Dies sind Gräser, die in Afrika und Südamerika als Weide verwendet werden. Loss-of-Function (LOF)-Allele sind in bekannten Genzielen, von denen vorhergesagt wird, dass sie die Eigenschaften dieser Gräser verbessern. Hanley und Kollegen suchten nach diesen Allelen oder Genvarianten unter den Akzessionen von Urochloa Arten und Megathyrsus maximus in der Genbanksammlung des CIAT.

„Wir haben eine neue Methodik für die Allel-Entdeckung von Kandidatengenen in einer Sammlung diploider und polyploider Akzessionen mit nur einem Entwurf der Genomsequenz für eine diploide Art als Referenz entwickelt“, schreiben Hanley und Kollegen. „Unser Ansatz, RNAseq und Bait-Capture zu kombinieren, bietet ein Mittel zur Vermeidung von Pseudogenen und zur Auflösung von Komplexitäten. Als Teil des Prozesses haben wir Genmodelle für 18 Schlüsselgene verbessert und zwei weitere als genau bestätigt U. ruziziensis v1-Genom. Unser Ansatz könnte für die Entdeckung von Allelen in anderen Pflanzensammlungen oder Populationen angepasst werden.“

„In Zukunft könnte der hier beschriebene Allele-Mining-Ansatz auf andere Gene angewendet werden und muss nicht auf Allele beschränkt sein, die der molekularen Funktion schaden. Beispielsweise wurden kürzlich Kandidatengene identifiziert, die Apomixis… und Spuckwanzenresistenz… zugrunde liegen Urochloa; Mit der verbesserten Fähigkeit, die Folgen von Varianten in diesen vorherzusagen, könnte ein Allele-Mining-Ansatz von Wert sein. Auch für Genziele wie diese, bei denen dominante Allele den Phänotyp beeinflussen können, könnte die Assoziationsgenetik für Kandidatengene ein nützlicher Ansatz sein, wie sie erfolgreich für das FT-Gen und die Blütezeit in angewendet wird Lolium perenne… Da sich das Wissen über Gene verbessert, wird das Allel-Mining von diversem Keimplasma zu einem immer leistungsfähigeren Werkzeug zur Identifizierung von Linien, die vorteilhaft in viele Pflanzenzüchtungsprogramme eingebracht werden könnten.“